Ο πρώτος γάμος του Βασίλη Αυλωνίτη ήταν με την Πόπη Αυλωνίτου, η οποία δούλευε στον θίασο ως μπαλαρίνα. Ο γάμος έληξε όταν ο Βασίλης Αυλωνίτης ερωτεύτηκε την Νίτσα Παπαδοπούλου, με την οποία έφυγε για το Παρίσι.
Πολύ σύντομα, όμως, και αυτός ο δεσμός έλαβε τέλος, όταν ο μεγάλος κωμικός αγάπησε και τελικά παντρεύτηκε την Γιογιό, με την οποία επέστρεψε στην Ελλάδα και απέκτησε δύο παιδιά: τον Γιάννη και την Ελένη.
Ο Γιάννης Αυλωνίτης ήταν άνθρωπος χαμηλών τόνων, μεγάλωσε και γαλουχήθηκε με όλες τις αρετές του πατέρα του, Βασίλη. Μαζί με την αδερφή του, Ελένη, βρίσκονταν συνεχώς στα γυρίσματα ταινιών. Πέθανε το 2021 σε ηλικία 78 ετών, αφού πάλεψε με πολλαπλά προβλήματα υγείας.
Δείτε φωτογραφία του γιου του, Γιάννη Αυλωνίτη, από το 1963 όταν έπαιζε τον ρόλο ενός υπαλλήλου στο θέατρο.
Ο Βασίλης Αυλωνίτης άφησε την τελευταία του πνοή στις 10 Μαρτίου του 1970, σε ηλικία 66 ετών, λίγες μέρες μετά την ολοκλήρωση της τελευταίας του ταινίας.
